Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROBO2Q9HCK4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROBO2Q9HCK4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms