Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPJQ9HC77 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms