Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms