Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASSF3Q86WH2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms