Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC16A9Q7RTY1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC16A9Q7RTY1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms