Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms