Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HES3Q5TGS1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms