Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms