Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HADHQ16836 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HADHQ16836 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms