Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms