Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GAPVD1Q14C86 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GAPVD1Q14C86 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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