Protein–RNA interactions for Protein: Q13045

FLII, Protein flightless-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLIIQ13045 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLIIQ13045 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLIIQ13045 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms