Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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FOXD4Q12950 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FOXD4Q12950 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FOXD4Q12950 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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FOXD4Q12950 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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