Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX10Q12887 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms