Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHD3Q12873 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHD3Q12873 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHD3Q12873 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHD3Q12873 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CHD3Q12873 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CHD3Q12873 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHD3Q12873 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHD3Q12873 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHD3Q12873 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CHD3Q12873 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHD3Q12873 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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