Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms