Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms