Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RWDD2BP57060 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RWDD2BP57060 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms