Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPAP49450 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms