Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR4A2P43354 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms