Protein–RNA interactions for Protein: P29371

TACR3, Neuromedin-K receptor, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR3P29371 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TACR3P29371 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TACR3P29371 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TACR3P29371 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms