Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSFA2P28290 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms