Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3BO95985 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3BO95985 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms