Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SELENOFO60613 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms