Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF1O43189 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms