Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRXO43186 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRXO43186 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRXO43186 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRXO43186 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms