Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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