Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DXG7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DXG7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms