Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms