Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms