Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP3Q9Y6F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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