Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms