Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms