Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBP3Q9NS15 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms