Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHANK3Q9BYB0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms