Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms