Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC35A4Q96G79 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms