Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms