Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms