Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM71DQ8N9W8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms