Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms