Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNDC1Q76NI1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNDC1Q76NI1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms