Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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C9orf47Q6ZRZ4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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C9orf47Q6ZRZ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf47Q6ZRZ4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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C9orf47Q6ZRZ4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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