Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms