Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms