Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms