Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf17Q53FE4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms