Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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