Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms