Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCAQ16586 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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